上海建設合同糾紛律師在建設工程合同糾紛中，當前司法實踐中主要存在八大難題:
1.在建設資金嚴重拖欠的背景下，如何保障農民工工資為最低水平；
2.一個項目簽訂了幾個合同，就是黑白合同，應該作為定價的依據；
3.拖欠項目資金應計利息，應如何計利息；
4.拖欠工程款可以延期，為什么可以延期，應該具備什么條件；
5.墊付資金是否違法，如何準確認定，如何處理；
6.發包人遲遲不確認工程結算依據是什么；
7.如何把握成本鑒定，鑒定結論是否能自然作為判斷依據；
8.審計報告與結算協議發生沖突時，以什么為準？
上述問題之所以成為法律難題，是因為原立法時無法預測司法實踐中的復雜情況，立法本身也沒有對這些問題做出明確規定，所以現有法律法規很難找到明確直接的法律依據來解決問題。面對這樣的實際情況，在目前立法難以一下子完善的前提下，最高法院的司法解釋不失為最有效的應對措施。
:通過連帶責任制度對農民工工資給予特殊保護。
農民工工資拖欠是直接影響社會穩定的大問題，農民工工資問題往往因轉包或違規轉包而復雜化。在立法層面，農民工工資的合同載體是勞動合同，即使在目前的建設項目法律框架下，也沒有涉及法律法規。關于拖欠農民工工資問題，《司法解釋》第29條對農民工工資問題作了特別保護性規定:“違法分包和轉包被確認無效，實際施工人和用人單位已經全面、切實履行合同，形成事實上的權利義務關系。實際施工人向用人單位主張權利的，人民法院應予支持。如果實際建造人起訴分包人、分包人、發包人為共同被告，要求承擔連帶責任，應予支持。”司法解釋可以從我國民事訴訟法第97條找到依據。法律規定:“人民法院根據當事人的申請，可以裁定先執行下列案件:(一)追索贍養費、扶養費、撫育費、撫恤金、醫療費；(二)追索勞動報酬；(3)因情況緊急，需先行實施。”我認為司法解釋對于解決農民工工資問題有法律依據。
此外，鑒于實踐中與農民工工資直接相關的勞動合同，司法解釋第七條還規定:“當事人主張總承包方和分包方與具有合法勞務作業資格的勞務作業承包方簽訂的勞務作業分包合同為分包合同；如果請求確認無效，將不予支持。司法解釋的這一相應規定事實上確認了勞動合同的合法性。至于勞動合同和分包合同的區別，主要看兩個合同所指向的對象。勞動合同只涉及人工費，不涉及分包工程；分包不僅涉及勞務，還涉及分包項目。從技術角度來說，勞動合同只計算勞動報酬，只包含勞動；分包，計算分包工程的價格，是承包勞務和材料的一種承包形式。
對策二:黑白合同按照中標合同的定價標準結算。
目前司法實踐中另一個比較突出的矛盾是，合同雙方在中標前后就一個項目簽訂了兩個或兩個以上的合同，而且幾個合同的計價方式不同。在施工過程中，雙方往往實際履行黑合同而沒有中標。對于這種情況，很多辦案法官不知所措，有著不同的辦案方式。司法解釋第二十三條對此作了統一規定:“當事人就同一建設工程訂立與中標合同實質內容不一致的其他合同的，應當以中標備案合同為結算工程款的依據。”司法解釋只是對黑白合同的工程款結算依據做出了統一規定，為司法實踐中黑白合同的主要矛盾提供了最有用的藥方，為這類疑難案件的實際解決做出了貢獻。
對于黑白合同的不同表現和評價標準，筆者認為黑白合同主要有三種情況:第一，是否通過招標來判斷黑白合同；二是地方政府對項目合同有備案或審批規定的，以是否備案或審批來判斷是非黑白合同；第三，不屬于以上兩種情況。當事人先后簽訂了兩份內容不同的合同，以判斷是否實際履行。針對以上三種不同的情況，由于按照法律的相關規定對其效力的準確認定，首先，如果本合同必須招標而不招標，就會出現黑白合同，以招標為準。二、如果一個合同按照政府規定要備案，則先后簽訂了兩個合同，一個備案，一個不備案，以備案的合同為準。第三，如果先后簽訂的兩份合同沒有具體要求，則以實際合同為準。這是判斷黑白合同有效性的標準。
對策三:逾期項目資金的應計利息根據不同情況計算。
拖欠項目資金案件審理中的另一個具體問題是如何計算拖欠項目資金的利息。由于承包商履約管理和數據積累的缺陷，司法實踐中往往難以確定工程款項何時拖欠，利息計算的起始時間成為審判中的難題。司法解釋第二十一條明確規定:“合同未約定拖欠工程款利息，發包人應按中國人民銀行同期同類貸款利率向承包人支付拖欠工程款利息。利息應從約定付款后的第二天開始計算。付款時間沒有約定或者難以按照約定確定付款時間的，按照合同約定從工程價款結算之日起計算利息。如果工程款項的結算時間難以確定，則從工程交付后的次日起計算。”
同時，對于墊付資金的承包工程，司法解釋第六條規定:“合同有墊付資金和墊付資金支付利息的約定。承包人主張發包人按約定支付預付款本息的，應予支持。合同中沒有約定預付利息，承包人主張發包人支付利息的，不予支持。合同沒有約定預付款，發包人的未付金額按工程款處理。”司法解釋對五種不同情況下建設資金拖欠利息的計算作出了不同的規定，能夠適應此類不同案件審理中的不同實際情況。
對策四:工程款拖欠可以延期工期，但承包商必須提前發出書面提醒。
催工程款的情況下還有一個比較復雜的問題:承包人因拖欠工程款提起訴訟時，發包人往往以工期逾期為由提出反訴，往往會提出幾億或幾千萬的逾期賠償，目的是抵消承包人的訴訟請求；而承包人以發包人逾期付款期限可以延期為由提出的反訴抗辯，在司法實踐中往往得不到法官的支持，因為法官的自由裁量權缺乏統一的操作規則。《合同法》規定，承包人可以順延工期。《合同法》第二百七十八條規定:“隱蔽工程隱蔽前，承包人應當通知發包人檢查。如果發包人未能及時檢查，承包人可以推遲工程日期，并有權要求賠償停工、窩工等損失。”《合同法》第二百八十三條規定:“發包人未按照約定的時間和要求提供原材料、設備、場地、資金和技術資料的，承包人可以順延工程日期，并有權要求賠償停工、窩工等損失。”《合同法》第二百八十四條規定:“因發包人原因造成工程暫停或者延誤施工的，發包人應當采取措施彌補或者減少損失，并賠償承包人因停工、窩工、運輸、機械設備搬遷、材料和構配件積壓等原因造成的損失和實際費用。”問題是這三條規定用的字都是“是”。就法律意義而言，“可以”是任意語氣詞。對于《合同法》上述三部法律規定的理由，法官有權根據案件的實際情況作出裁量，可以決定是否順延工期。至于法官應該以什么作為判斷標準，法律本身并沒有規定。
上海建設合同糾紛律師針對法官在是否延期工期問題上濫用過度自由裁量權，《司法解釋》第17條統一規定:“發包人違反《合同法》第278條、第283條、第284條規定的，承包人應當及時書面督促發包人在合理期限內履行義務。如果發包人未能在合理期限內履行其義務，承包人有權向發包人索賠。